2009 m. liepos 3 d. aplinkos ministro įsakymu Nr. D1-386 pakeistas Nuotekų tvarkymo reglamentas.
Nuotekų tvarkymo reglamento pakeitimai įsigalioja nuo 2009 m. liepos 15 d. Reglamento 1 priedo (Prioritetinių pavojingų medžiagų didžiausios leidžiamos koncentracijos) ir 2 priedo (Pavojingų ir kitų kontroliuojamų medžiagų didžiausios leidžiamos koncentracijos) nauja redakcija įsigalioja nuo 2010 m. gruodžio 31 d.
Pakeitimuose nurodyta, kad aglomeracijoms didesnėms kaip 2000 gyventojų ekvivalento (GE) laikinai leistina koncentracija (LLK) ir laikinai leistina tarša (LLT) gali būti nustatomi ne ilgesniam laikui kaip iki 2009 m. gruodžio 31 d. Išimtys taikomos tik esamoms iki 2000 GE aglomeracijoms, kai nėra techninių galimybių atitikti reglamento 29 punkte nurodytų reikalavimų ir aglomeracijos nuotekų tvarkymo sistemą eksploatuojantis asmuo pateikia taršos mažinimo planą, leidimuose nustatyta tvarka gali būti nustatoma faktines galimybes atitinkanti LLK ir LLT normatyvai, bet ne ilgesniam kaip plane numatytam priemonių įgyvendinimo laikotarpiui.
Nuotekų tvarkymo reglamente nurodyta, kad asmenys (veiklos vykdytojai), ketinantys išleisti arba išleidžiantys gamybines nuotekas į kitų asmenų valdomą nuotakyną, privalo informuoti nuotakyną eksploatuojantį asmenį, kiek ir kokių (nurodyti koncentraciją ir kiekį) prioritetinių pavojingų ir/ar pavojingų medžiagų su nuotekomis bus išleidžiama. Jei su nuotekomis išleidžiamų pavojingų medžiagų koncentracija yra lygi arba didesnė už šio Reglamento 2 priedo A ir B1 dalyse nurodytą „Ribinė koncentracija į nuotekų surinkimo sistemą“ vertę ir/ar kuriose yra 1 priede nurodytų prioritetinių pavojingų medžiagų, veiklos vykdytojai privalo užtikrinti šių medžiagų kontrolę ir apskaitą bei nustatyta tvarka teikti informaciją nuotakyno valdytojui.